Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP6Q3SY56 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms