Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UVSSAQ2YD98 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UVSSAQ2YD98 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms