Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2Q2TAL6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VWC2Q2TAL6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VWC2Q2TAL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms