Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTC1Q2NKJ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTC1Q2NKJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms