Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP7Q16576 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP7Q16576 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP7Q16576 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms