Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NBR1Q14596 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBR1Q14596 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NBR1Q14596 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NBR1Q14596 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBR1Q14596 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NBR1Q14596 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms