Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BECN1Q14457 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BECN1Q14457 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BECN1Q14457 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
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