Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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