Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 26.9
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TRA2AQ13595 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 DYNC1I2-211ENST00000423910 585 ntTSL 34.66□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 26.9
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TRA2AQ13595 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 26.3
TRA2AQ13595 CCDC93-203ENST00000437999 850 ntTSL 35.07□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 26.3
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TRA2AQ13595 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 26.2
TRA2AQ13595 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.711e-9■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.441e-9■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 UPF3A-203ENST00000474056 748 ntTSL 317.64■□□□□ 0.411e-9■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 UPF3A-206ENST00000480362 965 ntTSL 516.68■□□□□ 0.261e-9■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 UPF3A-208ENST00000484246 699 ntTSL 315.54■□□□□ 0.081e-9■■■■□ 26.1
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TRA2AQ13595 UPF3A-210ENST00000493727 937 ntTSL 511.81□□□□□ -0.521e-9■■■■□ 26.1
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TRA2AQ13595 UPF3A-205ENST00000479712 423 ntTSL 24.55□□□□□ -1.681e-9■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-7■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 FAM169A-204ENST00000510609 5908 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.711e-7■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 FAM169A-207ENST00000514215 5954 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.523e-6■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 WDR70-207ENST00000511906 5716 ntTSL 25.14□□□□□ -1.591e-7■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 SUPT6H-211ENST00000584312 483 ntTSL 25.12□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 26.1
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