Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2V1Q13404 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
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