Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P3Q13401 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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PMS2P3Q13401 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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