Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGDRQ13258 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGDRQ13258 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGDRQ13258 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGDRQ13258 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGDRQ13258 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGDRQ13258 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGDRQ13258 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGDRQ13258 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTGDRQ13258 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGDRQ13258 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGDRQ13258 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGDRQ13258 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTGDRQ13258 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGDRQ13258 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PTGDRQ13258 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGDRQ13258 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTGDRQ13258 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTGDRQ13258 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGDRQ13258 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGDRQ13258 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTGDRQ13258 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTGDRQ13258 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGDRQ13258 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTGDRQ13258 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGDRQ13258 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTGDRQ13258 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGDRQ13258 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGDRQ13258 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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