Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 LOT6YLR011W 576 nt7.79□□□□□ -1.16
NYV1Q12255 OGG1YML060W 1131 nt7.79□□□□□ -1.16
NYV1Q12255 YGR054WYGR054W 1929 nt7.79□□□□□ -1.16
NYV1Q12255 YBR241CYBR241C 1467 nt7.79□□□□□ -1.16
NYV1Q12255 CRF1YDR223W 1404 nt7.78□□□□□ -1.16
NYV1Q12255 BUD9YGR041W 1644 nt7.78□□□□□ -1.16
NYV1Q12255 YJR084WYJR084W 1272 nt7.78□□□□□ -1.16
NYV1Q12255 YPL257WYPL257W 582 nt7.78□□□□□ -1.16
NYV1Q12255 PAC2YER007W 1557 nt7.78□□□□□ -1.16
NYV1Q12255 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.77□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 YNL285WYNL285W 372 nt7.77□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 IRC11YOR013W 471 nt7.77□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 YLL066CYLL066C 3618 nt7.77□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 YLL067CYLL067C 3618 nt7.77□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 SKS1YPL026C 1509 nt7.77□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 ENB1YOL158C 1821 nt7.76□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 YDR015CYDR015C 240 nt7.76□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 MRPL28YDR462W 444 nt7.76□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 YLR126CYLR126C 756 nt7.76□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 HST3YOR025W 1344 nt7.76□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 PPT1YGR123C 1542 nt7.75□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 GCV3YAL044C 513 nt7.74□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 RPL10YLR075W 666 nt7.74□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 PRY3YJL078C 2646 nt7.74□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 POX1YGL205W 2247 nt7.74□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 SKG1YKR100C 1068 nt7.73□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 OPI11YPR044C 354 nt7.73□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 SNT309YPR101W 528 nt7.73□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 ELP3YPL086C 1674 nt7.73□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 EEB1YPL095C 1371 nt7.72□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 MAK31YCR020C-A 267 nt7.72□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 UFD1YGR048W 1086 nt7.72□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.71□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.71□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.71□□□□□ -1.17
NYV1Q12255 MNS1YJR131W 1650 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 RPN11YFR004W 921 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 ORM1YGR038W 669 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 RRP46YGR095C 672 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 MDE1YJR024C 735 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 RPS5YJR123W 678 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 ATP4YPL078C 735 nt7.71□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 ECM10YEL030W 1935 nt7.7□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.7□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 KSH1YNL024C-A 219 nt7.7□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt7.7□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 SPT3YDR392W 1014 nt7.69□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 DFR1YOR236W 636 nt7.69□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 PRS2YER099C 957 nt7.68□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 JNM1YMR294W 1122 nt7.68□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.68□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 ECM31YBR176W 939 nt7.68□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 YKR018CYKR018C 2178 nt7.68□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 EDE1YBL047C 4146 nt7.68□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 CIR2YOR356W 1896 nt7.68□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 RGD2YFL047W 2145 nt7.67□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 YCR041WYCR041W 333 nt7.67□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 HEM2YGL040C 1029 nt7.67□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 SNF4YGL115W 969 nt7.67□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 ASK1YKL052C 879 nt7.67□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 LDB16YCL005W 771 nt7.67□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 ICL1YER065C 1674 nt7.67□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 MET30YIL046W 1923 nt7.66□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 BUG1YDL099W 1026 nt7.66□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 YDR401WYDR401W 564 nt7.66□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 SEC24YIL109C 2781 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 YET3YDL072C 612 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 MIA40YKL195W 1212 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 NPL6YMR091C 1308 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 YNL120CYNL120C 486 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 RPS3YNL178W 723 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 CAF40YNL288W 1122 nt7.65□□□□□ -1.18
NYV1Q12255 UTP4YDR324C 2331 nt7.64□□□□□ -1.19
NYV1Q12255 NUP84YDL116W 2181 nt7.64□□□□□ -1.19
NYV1Q12255 SMC5YOL034W 3282 nt7.64□□□□□ -1.19
NYV1Q12255 ECM14YHR132C 1293 nt7.64□□□□□ -1.19
NYV1Q12255 SPO7YAL009W 780 nt7.64□□□□□ -1.19
NYV1Q12255 MEH1YKR007W 555 nt7.64□□□□□ -1.19
NYV1Q12255 HEM1YDR232W 1647 nt7.63□□□□□ -1.19
NYV1Q12255 NHA1YLR138W 2958 nt7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.9 ms