Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 SMK1YPR054W 1167 nt6.8□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 VMA3YEL027W 483 nt6.79□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 YNR014WYNR014W 639 nt6.79□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 DFR1YOR236W 636 nt6.79□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 CTF19YPL018W 1110 nt6.79□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 TAE1YBR261C 699 nt6.79□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 EHD3YDR036C 1503 nt6.78□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 HEM2YGL040C 1029 nt6.78□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 CUP2YGL166W 678 nt6.78□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 YJR146WYJR146W 354 nt6.78□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 KDX1YKL161C 1302 nt6.77□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 UIP5YKR044W 1332 nt6.77□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 HMS2YJR147W 1077 nt6.77□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 IMD1YAR073W 1212 nt6.77□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 PPH22YDL188C 1134 nt6.76□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 FAL1YDR021W 1200 nt6.76□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 COX16YJL003W 357 nt6.76□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 OGG1YML060W 1131 nt6.76□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YMR122CYMR122C 375 nt6.76□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 MSO1YNR049C 633 nt6.76□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YPL257WYPL257W 582 nt6.76□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 PEX31YGR004W 1389 nt6.76□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 EDE1YBL047C 4146 nt6.76□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.75□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 TPK1YJL164C 1194 nt6.75□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 MIA40YKL195W 1212 nt6.75□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YLR463CYLR463C 552 nt6.75□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 RRP9YPR137W 1722 nt6.74□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 TFG2YGR005C 1203 nt6.74□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 LYS1YIR034C 1122 nt6.74□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 TDH2YJR009C 999 nt6.74□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 GCN3YKR026C 918 nt6.74□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 TOS6YNL300W 309 nt6.74□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 OPI11YPR044C 354 nt6.74□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 ZWF1YNL241C 1518 nt6.74□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 ARE2YNR019W 1929 nt6.74□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 DYS1YHR068W 1164 nt6.73□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 MPC2YHR162W 390 nt6.73□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 SRL2YLR082C 1179 nt6.73□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.73□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 SGF29YCL010C 780 nt6.73□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YGR054WYGR054W 1929 nt6.73□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 HEM1YDR232W 1647 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 AIM3YBR108W 2844 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YPT1YFL038C 621 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YML018CYML018C 1182 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 KSH1YNL024C-A 219 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YNL120CYNL120C 486 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 RPL5YPL131W 894 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 PTC3YBL056W 1407 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YMR279CYMR279C 1623 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 DAL4YIR028W 1908 nt6.72□□□□□ -1.33
VPS54Q12071 YDR415CYDR415C 1125 nt6.71□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 FPR2YDR519W 408 nt6.71□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 GTT3YEL017W 1014 nt6.71□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 MSP1YGR028W 1089 nt6.71□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 RMA1YKL132C 1293 nt6.71□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 RUF23RUF23 254 nt6.71□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 PTC4YBR125C 1182 nt6.71□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 YLL066CYLL066C 3618 nt6.7□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 MAK32YCR019W 1092 nt6.7□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 FYV1YDR024W 486 nt6.7□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 SPG1YGR236C 288 nt6.7□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 YJR107WYJR107W 987 nt6.7□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 YPL277CYPL277C 1464 nt6.7□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 CIT3YPR001W 1461 nt6.7□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 SGE1YPR198W 1632 nt6.69□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 GTO3YMR251W 1101 nt6.69□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 MDE1YJR024C 735 nt6.68□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 FBA1YKL060C 1080 nt6.68□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 YMR295CYMR295C 594 nt6.68□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 YTH1YPR107C 627 nt6.68□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 MSY1YPL097W 1479 nt6.67□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 VMA2YBR127C 1554 nt6.67□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 SHO1YER118C 1104 nt6.67□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 ADH5YBR145W 1056 nt6.67□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 YPR196WYPR196W 1413 nt6.67□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 FET4YMR319C 1659 nt6.66□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 CTF8YHR191C 402 nt6.66□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 LDB16YCL005W 771 nt6.66□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 NOG2YNR053C 1461 nt6.66□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 YKR032WYKR032W 315 nt6.65□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 FSF1YOR271C 984 nt6.65□□□□□ -1.34
VPS54Q12071 GLN3YER040W 2193 nt6.64□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 SDH4YDR178W 546 nt6.64□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 SQT1YIR012W 1296 nt6.64□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 VPS24YKL041W 675 nt6.64□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 GLC8YMR311C 690 nt6.64□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 ATP4YPL078C 735 nt6.64□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 ECM31YBR176W 939 nt6.64□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 THI2YBR240C 1353 nt6.64□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.63□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 CCC2YDR270W 3015 nt6.63□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 FPR3YML074C 1236 nt6.63□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 MRPL10YNL284C 969 nt6.63□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 TKL2YBR117C 2046 nt6.63□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 YBR226CYBR226C 411 nt6.63□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 PPT1YGR123C 1542 nt6.62□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 OPI8YKR035C 642 nt6.62□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 PUS5YLR165C 765 nt6.62□□□□□ -1.35
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