Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELP6Q0PNE2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP6Q0PNE2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP6Q0PNE2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms