Protein–RNA interactions for Protein: Q08960

TYW1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TYW1Q08960 YML094C-AYML094C-A 402 nt8.66□□□□□ -1.02
TYW1Q08960 SFT2YBL102W 648 nt8.66□□□□□ -1.02
TYW1Q08960 ARG7YMR062C 1326 nt8.65□□□□□ -1.02
TYW1Q08960 NMA2YGR010W 1188 nt8.65□□□□□ -1.02
TYW1Q08960 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.65□□□□□ -1.02
TYW1Q08960 YNL017CYNL017C 339 nt8.65□□□□□ -1.02
TYW1Q08960 YOL166CYOL166C 339 nt8.65□□□□□ -1.02
TYW1Q08960 YGL114WYGL114W 2178 nt8.65□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 KES1YPL145C 1305 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 TIF3YPR163C 1311 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 YDL114WYDL114W 927 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 YFT2YDR319C 825 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 YEL028WYEL028W 462 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 LDB7YBL006C 543 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 YOL162WYOL162W 648 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 THI80YOR143C 960 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 ERV2YPR037C 591 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 THI3YDL080C 1830 nt8.64□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 ARO3YDR035W 1113 nt8.63□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 PPE1YHR075C 1203 nt8.63□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 AIM20YIL158W 615 nt8.63□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 AIM23YJL131C 1071 nt8.63□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 NCE103YNL036W 666 nt8.63□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 MUP1YGR055W 1725 nt8.63□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 DRS1YLL008W 2259 nt8.63□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 PET112YBL080C 1626 nt8.62□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 PRP9YDL030W 1593 nt8.62□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 CDC3YLR314C 1563 nt8.62□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 NDL1YLR254C 570 nt8.62□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 PSY3YLR376C 729 nt8.62□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 YLR402WYLR402W 192 nt8.62□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 NCE102YPR149W 522 nt8.62□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 FRA1YLL029W 2250 nt8.61□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 KRR1YCL059C 951 nt8.61□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 SCL1YGL011C 759 nt8.61□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 IFA38YBR159W 1044 nt8.61□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 PRP46YPL151C 1356 nt8.61□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 GUS1YGL245W 2127 nt8.6□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 HIM1YDR317W 1245 nt8.6□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 YLR118CYLR118C 684 nt8.6□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 SEC65YML105C 822 nt8.6□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 ADH6YMR318C 1083 nt8.6□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 EFM2YBR271W 1260 nt8.6□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 TMS1YDR105C 1422 nt8.6□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 PIB1YDR313C 861 nt8.59□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 ERV14YGL054C 417 nt8.59□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 YAL064WYAL064W 285 nt8.59□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 JNM1YMR294W 1122 nt8.59□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 IRC11YOR013W 471 nt8.59□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 RPN8YOR261C 1017 nt8.59□□□□□ -1.03
TYW1Q08960 HXT8YJL214W 1710 nt8.58□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 FCY22YER060W-A 1593 nt8.58□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt8.58□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YLF2YHL014C 1218 nt8.58□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 MPM1YJL066C 759 nt8.58□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 GPM1YKL152C 744 nt8.58□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 RPC31YNL151C 756 nt8.58□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YDR220CYDR220C 294 nt8.57□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 PEF1YGR058W 1008 nt8.57□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 TES1YJR019C 1050 nt8.57□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 MTR2YKL186C 555 nt8.57□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 IMD1YAR073W 1212 nt8.57□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 SCP1YOR367W 603 nt8.57□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 GDA1YEL042W 1557 nt8.56□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 OSM1YJR051W 1506 nt8.56□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 PEX19YDL065C 1029 nt8.56□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 BTT1YDR252W 450 nt8.56□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 ORM2YLR350W 651 nt8.56□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YML101C-AYML101C-A 318 nt8.56□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 ESC2YDR363W 1371 nt8.56□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YHR218WYHR218W 1812 nt8.56□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YLL047WYLL047W 384 nt8.55□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 HAL1YPR005C 885 nt8.55□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 RCK1YGL158W 1539 nt8.54□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YLR365WYLR365W 333 nt8.54□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 SML1YML058W 315 nt8.54□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 CSM3YMR048W 954 nt8.54□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 MSS116YDR194C 1995 nt8.53□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 LPL1YOR059C 1353 nt8.53□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 PCL2YDL127W 927 nt8.53□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 NSE3YDR288W 912 nt8.53□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YUH1YJR099W 711 nt8.53□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YLR202CYLR202C 327 nt8.53□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 YMR178WYMR178W 825 nt8.53□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 IZH4YOL101C 939 nt8.53□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 SUI3YPL237W 858 nt8.53□□□□□ -1.04
TYW1Q08960 VRP1YLR337C 2454 nt8.52□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 YSC83YHR017W 1158 nt8.52□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt8.52□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 URA4YLR420W 1095 nt8.52□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 ERG10YPL028W 1197 nt8.52□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 COQ8YGL119W 1506 nt8.52□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 PTM1YKL039W 1572 nt8.52□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 YJR124CYJR124C 1347 nt8.52□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 DRN1YGR093W 1524 nt8.51□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 AGP3YFL055W 1677 nt8.51□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 GPD1YDL022W 1176 nt8.51□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 YDR467CYDR467C 327 nt8.51□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 SCEIQ0160 708 nt8.51□□□□□ -1.05
TYW1Q08960 MDH1YKL085W 1005 nt8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42 ms