Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 KSH1YNL024C-A 219 nt7.6□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.6□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 PPT1YGR123C 1542 nt7.59□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 GUT1YHL032C 2130 nt7.59□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 SHP1YBL058W 1272 nt7.59□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YNL200CYNL200C 741 nt7.59□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YBR241CYBR241C 1467 nt7.59□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 SKS1YPL026C 1509 nt7.58□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.58□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 YNL017CYNL017C 339 nt7.58□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 MTF2YDL044C 1323 nt7.57□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 SNF4YGL115W 969 nt7.57□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 YNL285WYNL285W 372 nt7.57□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 YOR300WYOR300W 309 nt7.57□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 POX1YGL205W 2247 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 MDE1YJR024C 735 nt7.56□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 ATG22YCL038C 1587 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 DON1YDR273W 1098 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 GCV3YAL044C 513 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 YLR112WYLR112W 420 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 EDE1YBL047C 4146 nt7.55□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 YKR018CYKR018C 2178 nt7.54□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 MAK31YCR020C-A 267 nt7.54□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 IDP3YNL009W 1263 nt7.54□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 LDB16YCL005W 771 nt7.54□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 SEC24YIL109C 2781 nt7.53□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 MTR3YGR158C 753 nt7.53□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 MIA40YKL195W 1212 nt7.53□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 YLR126CYLR126C 756 nt7.53□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 DFR1YOR236W 636 nt7.53□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt7.53□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 ECM31YBR176W 939 nt7.53□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 POB3YML069W 1659 nt7.53□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 RGD2YFL047W 2145 nt7.52□□□□□ -1.2
SYF1Q04048 PRB1YEL060C 1908 nt7.52□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 RPS5YJR123W 678 nt7.51□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.5□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 snR82snR82 268 nt7.5□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 BIM1YER016W 1035 nt7.5□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 MEH1YKR007W 555 nt7.5□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 NHA1YLR138W 2958 nt7.5□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 YNL120CYNL120C 486 nt7.49□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 RPS3YNL178W 723 nt7.49□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 CAF40YNL288W 1122 nt7.49□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 HEM1YDR232W 1647 nt7.49□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 ICL1YER065C 1674 nt7.48□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 ECM14YHR132C 1293 nt7.48□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 MTC2YKL098W 1074 nt7.48□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 AIM2YAL049C 741 nt7.48□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 RSC30YHR056C 2652 nt7.48□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 HAL5YJL165C 2568 nt7.48□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 ERS1YCR075C 783 nt7.47□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 BUG1YDL099W 1026 nt7.47□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 HEM2YGL040C 1029 nt7.47□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 YHC3YJL059W 1227 nt7.47□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 DPH5YLR172C 903 nt7.47□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 JNM1YMR294W 1122 nt7.47□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 NUP84YDL116W 2181 nt7.47□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 RIX7YLL034C 2514 nt7.47□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 MNS1YJR131W 1650 nt7.47□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 UTP4YDR324C 2331 nt7.46□□□□□ -1.21
SYF1Q04048 YET3YDL072C 612 nt7.46□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 PRS2YER099C 957 nt7.46□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 ASK1YKL052C 879 nt7.46□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 MRPS12YNR036C 462 nt7.46□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 TOD6YBL054W 1578 nt7.46□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 RPN11YFR004W 921 nt7.45□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 RPP1YHR062C 882 nt7.45□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 DAL7YIR031C 1665 nt7.44□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 ELA1YNL230C 1140 nt7.44□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 HBN1YCL026C-B 582 nt7.44□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 FAF1YIL019W 1041 nt7.43□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 AMD2YDR242W 1650 nt7.42□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 UGX2YDL169C 672 nt7.42□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 DFM1YDR411C 1026 nt7.42□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 SPO7YAL009W 780 nt7.42□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 ARC35YNR035C 1029 nt7.42□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 YOR012WYOR012W 414 nt7.42□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 MCH2YKL221W 1422 nt7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.6 ms