Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC25A11Q02978 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A11Q02978 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A11Q02978 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms