Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKB2Q00653 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKB2Q00653 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFKB2Q00653 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms