Protein–RNA interactions for Protein: Q00578

SSL2, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, yeastyeast

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSL2Q00578 MRPL19YNL185C 477 nt7.25□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 DAL7YIR031C 1665 nt7.25□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 PGM1YKL127W 1713 nt7.24□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 RAP1YNL216W 2484 nt7.24□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 CRH1YGR189C 1524 nt7.24□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 COA1YIL157C 594 nt7.24□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 RMA1YKL132C 1293 nt7.24□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 YPL257WYPL257W 582 nt7.24□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 LAT1YNL071W 1449 nt7.24□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 GTT3YEL017W 1014 nt7.23□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 YIR042CYIR042C 711 nt7.23□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 AIM24YJR080C 1185 nt7.23□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 COQ3YOL096C 939 nt7.23□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 HMT1YBR034C 1047 nt7.23□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 COX10YPL172C 1389 nt7.22□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 CIS3YJL158C 684 nt7.22□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 RKI1YOR095C 777 nt7.22□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 LSC1YOR142W 990 nt7.22□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 MOD5YOR274W 1287 nt7.22□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 YPR076WYPR076W 375 nt7.22□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 ASR1YPR093C 867 nt7.22□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 GFA1YKL104C 2154 nt7.22□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 PRE5YMR314W 705 nt7.21□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 KSH1YNL024C-A 219 nt7.21□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 YNL200CYNL200C 741 nt7.21□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 VPS61YDR136C 573 nt7.2□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 TMT1YER175C 900 nt7.2□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 YPL071CYPL071C 471 nt7.2□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 ARE2YNR019W 1929 nt7.19□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 PPH21YDL134C 1110 nt7.19□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 YHC3YJL059W 1227 nt7.19□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 DUS4YLR405W 1104 nt7.19□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 MPH3YJR160C 1809 nt7.19□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 BIO3YNR058W 1443 nt7.18□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 IMA5YJL216C 1746 nt7.18□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 FMP40YPL222W 2067 nt7.18□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 SMC5YOL034W 3282 nt7.18□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 LDB7YBL006C 543 nt7.18□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 MCP1YOR228C 909 nt7.18□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 YOR268CYOR268C 399 nt7.18□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 CEF1YMR213W 1773 nt7.18□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 TPO3YPR156C 1869 nt7.17□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 HRQ1YDR291W 3234 nt7.17□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 FAL1YDR021W 1200 nt7.17□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 YDR278CYDR278C 318 nt7.17□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 MDE1YJR024C 735 nt7.17□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 CIT3YPR001W 1461 nt7.17□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 BIM1YER016W 1035 nt7.16□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 YRB2YIL063C 984 nt7.16□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 QCR8YJL166W 285 nt7.16□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 BSC4YNL269W 396 nt7.16□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 YTP1YNL237W 1380 nt7.16□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 CDC16YKL022C 2523 nt7.15□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 ARP10YDR106W 855 nt7.15□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 YNL165WYNL165W 1221 nt7.15□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 LGE1YPL055C 999 nt7.15□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 UTP6YDR449C 1323 nt7.15□□□□□ -1.26
SSL2Q00578 SNU71YGR013W 1863 nt7.15□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 STB5YHR178W 2232 nt7.15□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 CSC1YLR241W 2349 nt7.15□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 EHD3YDR036C 1503 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 GPI11YDR302W 660 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 COX15YER141W 1461 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 DMA1YHR115C 1251 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 EFM3YJR129C 1020 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 SRL2YLR082C 1179 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 YML083CYML083C 1257 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 SWP1YMR149W 861 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 IES2YNL215W 963 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 GPD2YOL059W 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 LDB16YCL005W 771 nt7.14□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 CCT8YJL008C 1707 nt7.13□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 FET4YMR319C 1659 nt7.13□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 SHO1YER118C 1104 nt7.13□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 PTC4YBR125C 1182 nt7.13□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 PYC2YBR218C 3543 nt7.12□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 MAK32YCR019W 1092 nt7.12□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 RNH1YMR234W 1047 nt7.12□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 CTF19YPL018W 1110 nt7.12□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 AMD2YDR242W 1650 nt7.12□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 PRP2YNR011C 2631 nt7.12□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 YHK8YHR048W 1545 nt7.11□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 RGD1YBR260C 2001 nt7.11□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 RBS1YDL189W 1374 nt7.11□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.11□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 LYS1YIR034C 1122 nt7.11□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 YAR064WYAR064W 300 nt7.11□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 MSO1YNR049C 633 nt7.11□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 DAP1YPL170W 459 nt7.11□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 SPE3YPR069C 882 nt7.11□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 YOL036WYOL036W 2286 nt7.1□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.1□□□□□ -1.27
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SSL2Q00578 YML6YML025C 861 nt7.1□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 GTO3YMR251W 1101 nt7.1□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 KTR1YOR099W 1182 nt7.1□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 RIO1YOR119C 1455 nt7.1□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 ADE17YMR120C 1779 nt7.09□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 YPL277CYPL277C 1464 nt7.09□□□□□ -1.27
SSL2Q00578 SGE1YPR198W 1632 nt7.09□□□□□ -1.28
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