Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX4P78413 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX4P78413 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX4P78413 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX4P78413 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX4P78413 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX4P78413 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX4P78413 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX4P78413 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX4P78413 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX4P78413 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX4P78413 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX4P78413 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX4P78413 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX4P78413 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX4P78413 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX4P78413 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX4P78413 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX4P78413 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX4P78413 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX4P78413 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX4P78413 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRX4P78413 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRX4P78413 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRX4P78413 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX4P78413 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX4P78413 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX4P78413 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX4P78413 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX4P78413 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX4P78413 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX4P78413 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX4P78413 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX4P78413 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX4P78413 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX4P78413 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRX4P78413 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX4P78413 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRX4P78413 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX4P78413 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX4P78413 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX4P78413 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX4P78413 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX4P78413 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRX4P78413 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX4P78413 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX4P78413 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX4P78413 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRX4P78413 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX4P78413 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX4P78413 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX4P78413 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX4P78413 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX4P78413 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX4P78413 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IRX4P78413 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX4P78413 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX4P78413 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX4P78413 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX4P78413 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX4P78413 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX4P78413 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX4P78413 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX4P78413 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX4P78413 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX4P78413 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX4P78413 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX4P78413 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX4P78413 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX4P78413 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX4P78413 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX4P78413 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX4P78413 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX4P78413 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX4P78413 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX4P78413 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX4P78413 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX4P78413 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX4P78413 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX4P78413 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX4P78413 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX4P78413 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX4P78413 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX4P78413 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX4P78413 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX4P78413 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX4P78413 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX4P78413 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX4P78413 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX4P78413 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX4P78413 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX4P78413 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX4P78413 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX4P78413 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX4P78413 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX4P78413 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX4P78413 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX4P78413 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX4P78413 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX4P78413 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms