Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRX6P78412 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRX6P78412 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRX6P78412 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRX6P78412 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRX6P78412 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
IRX6P78412 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
IRX6P78412 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
IRX6P78412 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
IRX6P78412 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
IRX6P78412 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
IRX6P78412 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
IRX6P78412 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
IRX6P78412 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
IRX6P78412 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
IRX6P78412 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
IRX6P78412 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
IRX6P78412 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
IRX6P78412 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IRX6P78412 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
IRX6P78412 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
IRX6P78412 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IRX6P78412 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IRX6P78412 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IRX6P78412 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IRX6P78412 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
IRX6P78412 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
IRX6P78412 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
IRX6P78412 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IRX6P78412 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IRX6P78412 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
IRX6P78412 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
IRX6P78412 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
IRX6P78412 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
IRX6P78412 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
IRX6P78412 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
IRX6P78412 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IRX6P78412 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
IRX6P78412 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
IRX6P78412 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
IRX6P78412 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
IRX6P78412 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
IRX6P78412 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
IRX6P78412 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
IRX6P78412 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
IRX6P78412 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
IRX6P78412 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
IRX6P78412 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
IRX6P78412 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
IRX6P78412 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
IRX6P78412 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
IRX6P78412 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
IRX6P78412 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
IRX6P78412 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
IRX6P78412 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
IRX6P78412 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
IRX6P78412 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
IRX6P78412 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
IRX6P78412 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
IRX6P78412 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
IRX6P78412 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
IRX6P78412 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
IRX6P78412 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
IRX6P78412 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
IRX6P78412 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
IRX6P78412 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
IRX6P78412 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
IRX6P78412 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
IRX6P78412 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
IRX6P78412 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
IRX6P78412 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
IRX6P78412 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRX6P78412 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRX6P78412 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRX6P78412 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRX6P78412 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRX6P78412 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRX6P78412 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRX6P78412 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
IRX6P78412 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
IRX6P78412 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
IRX6P78412 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
IRX6P78412 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
IRX6P78412 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
IRX6P78412 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
IRX6P78412 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
IRX6P78412 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
IRX6P78412 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
IRX6P78412 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRX6P78412 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRX6P78412 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRX6P78412 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRX6P78412 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRX6P78412 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
IRX6P78412 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
IRX6P78412 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
IRX6P78412 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
IRX6P78412 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
IRX6P78412 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
IRX6P78412 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms