Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC1P78348 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ASIC1P78348 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms