Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23P62829 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23P62829 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23P62829 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23P62829 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23P62829 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23P62829 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23P62829 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23P62829 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23P62829 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23P62829 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23P62829 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23P62829 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23P62829 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23P62829 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23P62829 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23P62829 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23P62829 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23P62829 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23P62829 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23P62829 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23P62829 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23P62829 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23P62829 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23P62829 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23P62829 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23P62829 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23P62829 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL23P62829 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23P62829 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23P62829 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23P62829 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23P62829 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23P62829 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23P62829 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23P62829 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23P62829 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL23P62829 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL23P62829 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23P62829 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23P62829 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23P62829 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL23P62829 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23P62829 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23P62829 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23P62829 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23P62829 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23P62829 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23P62829 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23P62829 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL23P62829 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23P62829 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23P62829 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23P62829 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23P62829 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23P62829 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23P62829 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL23P62829 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23P62829 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23P62829 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23P62829 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23P62829 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL23P62829 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23P62829 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23P62829 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23P62829 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23P62829 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23P62829 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23P62829 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23P62829 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL23P62829 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL23P62829 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL23P62829 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL23P62829 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL23P62829 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL23P62829 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL23P62829 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL23P62829 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL23P62829 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms