Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UFM1P61960 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UFM1P61960 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UFM1P61960 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UFM1P61960 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFM1P61960 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFM1P61960 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFM1P61960 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFM1P61960 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFM1P61960 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFM1P61960 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFM1P61960 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UFM1P61960 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFM1P61960 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFM1P61960 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFM1P61960 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFM1P61960 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFM1P61960 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UFM1P61960 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFM1P61960 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFM1P61960 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFM1P61960 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFM1P61960 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UFM1P61960 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFM1P61960 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFM1P61960 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFM1P61960 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFM1P61960 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFM1P61960 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFM1P61960 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFM1P61960 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFM1P61960 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFM1P61960 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFM1P61960 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFM1P61960 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFM1P61960 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UFM1P61960 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFM1P61960 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFM1P61960 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFM1P61960 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UFM1P61960 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFM1P61960 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFM1P61960 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFM1P61960 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFM1P61960 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFM1P61960 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFM1P61960 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFM1P61960 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFM1P61960 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFM1P61960 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFM1P61960 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFM1P61960 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UFM1P61960 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFM1P61960 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFM1P61960 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFM1P61960 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UFM1P61960 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFM1P61960 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFM1P61960 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFM1P61960 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFM1P61960 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UFM1P61960 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UFM1P61960 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFM1P61960 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFM1P61960 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFM1P61960 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFM1P61960 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFM1P61960 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UFM1P61960 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFM1P61960 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFM1P61960 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UFM1P61960 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFM1P61960 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFM1P61960 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms