Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVFC1-1P60608 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms