Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA1P56199 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA1P56199 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms