Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP9P55211 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP9P55211 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP9P55211 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP9P55211 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP9P55211 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP9P55211 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP9P55211 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP9P55211 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP9P55211 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP9P55211 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP9P55211 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP9P55211 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP9P55211 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP9P55211 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP9P55211 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP9P55211 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP9P55211 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP9P55211 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP9P55211 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP9P55211 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP9P55211 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP9P55211 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP9P55211 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP9P55211 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP9P55211 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP9P55211 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP9P55211 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP9P55211 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP9P55211 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP9P55211 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP9P55211 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP9P55211 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP9P55211 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP9P55211 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP9P55211 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP9P55211 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP9P55211 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP9P55211 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP9P55211 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP9P55211 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP9P55211 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP9P55211 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP9P55211 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP9P55211 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP9P55211 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP9P55211 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP9P55211 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP9P55211 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP9P55211 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP9P55211 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP9P55211 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP9P55211 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP9P55211 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP9P55211 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP9P55211 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP9P55211 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP9P55211 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP9P55211 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP9P55211 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP9P55211 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP9P55211 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP9P55211 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP9P55211 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP9P55211 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP9P55211 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP9P55211 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP9P55211 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP9P55211 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP9P55211 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP9P55211 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP9P55211 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASP9P55211 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP9P55211 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP9P55211 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP9P55211 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.1 ms