Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN3P54252 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN3P54252 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms