Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK2P53671 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIMK2P53671 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIMK2P53671 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms