Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
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