Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABGGTBP53611 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTBP53611 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTBP53611 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTBP53611 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTBP53611 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms