Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CX3CR1P49238 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CX3CR1P49238 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CX3CR1P49238 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CX3CR1P49238 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CX3CR1P49238 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CX3CR1P49238 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CX3CR1P49238 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CX3CR1P49238 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CX3CR1P49238 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CX3CR1P49238 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CX3CR1P49238 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CX3CR1P49238 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CX3CR1P49238 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CX3CR1P49238 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CX3CR1P49238 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CX3CR1P49238 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CX3CR1P49238 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CX3CR1P49238 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CX3CR1P49238 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CX3CR1P49238 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CX3CR1P49238 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CX3CR1P49238 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CX3CR1P49238 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CX3CR1P49238 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CX3CR1P49238 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CX3CR1P49238 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CX3CR1P49238 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CX3CR1P49238 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CX3CR1P49238 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CX3CR1P49238 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CX3CR1P49238 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms