Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX3P48380 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX3P48380 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX3P48380 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX3P48380 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX3P48380 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX3P48380 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX3P48380 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX3P48380 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX3P48380 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX3P48380 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX3P48380 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX3P48380 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX3P48380 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX3P48380 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX3P48380 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX3P48380 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX3P48380 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX3P48380 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX3P48380 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX3P48380 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX3P48380 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX3P48380 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX3P48380 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX3P48380 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX3P48380 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX3P48380 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX3P48380 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX3P48380 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX3P48380 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX3P48380 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX3P48380 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX3P48380 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX3P48380 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX3P48380 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX3P48380 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX3P48380 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX3P48380 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX3P48380 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX3P48380 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX3P48380 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX3P48380 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX3P48380 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFX3P48380 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX3P48380 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX3P48380 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX3P48380 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX3P48380 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX3P48380 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX3P48380 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX3P48380 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX3P48380 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX3P48380 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX3P48380 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFX3P48380 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX3P48380 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX3P48380 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX3P48380 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX3P48380 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX3P48380 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX3P48380 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX3P48380 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX3P48380 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX3P48380 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX3P48380 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX3P48380 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX3P48380 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX3P48380 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX3P48380 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX3P48380 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX3P48380 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX3P48380 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX3P48380 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX3P48380 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX3P48380 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX3P48380 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX3P48380 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX3P48380 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX3P48380 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX3P48380 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX3P48380 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX3P48380 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX3P48380 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX3P48380 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX3P48380 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX3P48380 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX3P48380 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX3P48380 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX3P48380 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX3P48380 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms