Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN1BP46527 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN1BP46527 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms