Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD52P43351 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD52P43351 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD52P43351 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD52P43351 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD52P43351 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD52P43351 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD52P43351 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD52P43351 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD52P43351 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD52P43351 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD52P43351 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD52P43351 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD52P43351 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD52P43351 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD52P43351 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD52P43351 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD52P43351 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD52P43351 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD52P43351 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD52P43351 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD52P43351 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD52P43351 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD52P43351 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD52P43351 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD52P43351 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD52P43351 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD52P43351 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD52P43351 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD52P43351 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD52P43351 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD52P43351 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD52P43351 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD52P43351 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD52P43351 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD52P43351 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD52P43351 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD52P43351 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD52P43351 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD52P43351 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD52P43351 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD52P43351 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD52P43351 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD52P43351 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD52P43351 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD52P43351 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD52P43351 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD52P43351 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD52P43351 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD52P43351 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD52P43351 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD52P43351 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD52P43351 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD52P43351 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD52P43351 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD52P43351 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD52P43351 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD52P43351 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD52P43351 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD52P43351 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD52P43351 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD52P43351 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD52P43351 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD52P43351 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD52P43351 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD52P43351 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD52P43351 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD52P43351 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD52P43351 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD52P43351 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD52P43351 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD52P43351 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD52P43351 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD52P43351 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD52P43351 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD52P43351 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD52P43351 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD52P43351 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD52P43351 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD52P43351 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms