Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRATP43155 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRATP43155 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRATP43155 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRATP43155 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRATP43155 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRATP43155 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRATP43155 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRATP43155 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRATP43155 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRATP43155 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRATP43155 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRATP43155 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRATP43155 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRATP43155 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRATP43155 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRATP43155 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRATP43155 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRATP43155 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRATP43155 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRATP43155 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRATP43155 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRATP43155 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRATP43155 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRATP43155 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRATP43155 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRATP43155 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRATP43155 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRATP43155 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRATP43155 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRATP43155 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRATP43155 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRATP43155 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRATP43155 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRATP43155 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRATP43155 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRATP43155 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRATP43155 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRATP43155 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRATP43155 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRATP43155 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRATP43155 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRATP43155 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRATP43155 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRATP43155 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRATP43155 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRATP43155 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRATP43155 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRATP43155 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRATP43155 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRATP43155 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRATP43155 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRATP43155 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRATP43155 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRATP43155 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRATP43155 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRATP43155 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRATP43155 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRATP43155 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRATP43155 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRATP43155 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRATP43155 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRATP43155 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRATP43155 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRATP43155 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRATP43155 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRATP43155 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRATP43155 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRATP43155 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRATP43155 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRATP43155 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRATP43155 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRATP43155 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRATP43155 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRATP43155 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRATP43155 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRATP43155 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRATP43155 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRATP43155 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRATP43155 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRATP43155 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRATP43155 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms