Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF5P43026 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF5P43026 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF5P43026 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF5P43026 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF5P43026 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF5P43026 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF5P43026 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF5P43026 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF5P43026 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF5P43026 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF5P43026 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF5P43026 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF5P43026 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF5P43026 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF5P43026 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF5P43026 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF5P43026 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF5P43026 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF5P43026 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDF5P43026 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF5P43026 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF5P43026 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF5P43026 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF5P43026 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF5P43026 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF5P43026 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF5P43026 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF5P43026 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF5P43026 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF5P43026 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF5P43026 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF5P43026 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF5P43026 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF5P43026 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF5P43026 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF5P43026 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF5P43026 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF5P43026 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF5P43026 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF5P43026 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF5P43026 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF5P43026 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF5P43026 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF5P43026 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF5P43026 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF5P43026 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF5P43026 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF5P43026 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF5P43026 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF5P43026 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF5P43026 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF5P43026 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF5P43026 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF5P43026 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF5P43026 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF5P43026 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF5P43026 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF5P43026 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF5P43026 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF5P43026 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF5P43026 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF5P43026 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF5P43026 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF5P43026 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF5P43026 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF5P43026 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF5P43026 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF5P43026 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF5P43026 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF5P43026 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF5P43026 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF5P43026 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF5P43026 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF5P43026 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF5P43026 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF5P43026 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF5P43026 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF5P43026 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF5P43026 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF5P43026 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF5P43026 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF5P43026 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF5P43026 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF5P43026 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF5P43026 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF5P43026 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF5P43026 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF5P43026 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF5P43026 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF5P43026 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms