Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC1A1P43005 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A1P43005 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A1P43005 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms