Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PBX1P40424 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PBX1P40424 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PBX1P40424 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PBX1P40424 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PBX1P40424 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX1P40424 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX1P40424 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX1P40424 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX1P40424 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX1P40424 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX1P40424 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PBX1P40424 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX1P40424 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX1P40424 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX1P40424 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX1P40424 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX1P40424 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX1P40424 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX1P40424 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PBX1P40424 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PBX1P40424 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PBX1P40424 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PBX1P40424 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PBX1P40424 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PBX1P40424 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PBX1P40424 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PBX1P40424 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PBX1P40424 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX1P40424 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX1P40424 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX1P40424 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX1P40424 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX1P40424 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX1P40424 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PBX1P40424 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PBX1P40424 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PBX1P40424 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PBX1P40424 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PBX1P40424 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PBX1P40424 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PBX1P40424 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX1P40424 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX1P40424 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX1P40424 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PBX1P40424 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX1P40424 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX1P40424 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX1P40424 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX1P40424 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PBX1P40424 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBX1P40424 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBX1P40424 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBX1P40424 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PBX1P40424 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX1P40424 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX1P40424 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX1P40424 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX1P40424 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX1P40424 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PBX1P40424 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX1P40424 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX1P40424 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX1P40424 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX1P40424 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX1P40424 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX1P40424 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX1P40424 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PBX1P40424 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX1P40424 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX1P40424 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX1P40424 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX1P40424 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX1P40424 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX1P40424 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX1P40424 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX1P40424 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PBX1P40424 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PBX1P40424 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PBX1P40424 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PBX1P40424 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PBX1P40424 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PBX1P40424 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PBX1P40424 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms