Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGCXP38435 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGCXP38435 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGCXP38435 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGCXP38435 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGCXP38435 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGCXP38435 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGCXP38435 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGCXP38435 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGCXP38435 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GGCXP38435 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GGCXP38435 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGCXP38435 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGCXP38435 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGCXP38435 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGCXP38435 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGCXP38435 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGCXP38435 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGCXP38435 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGCXP38435 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGCXP38435 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGCXP38435 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGCXP38435 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGCXP38435 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGCXP38435 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGCXP38435 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGCXP38435 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGCXP38435 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGCXP38435 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGCXP38435 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGCXP38435 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGCXP38435 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGCXP38435 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGCXP38435 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGCXP38435 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGCXP38435 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGCXP38435 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGCXP38435 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGCXP38435 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGCXP38435 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGCXP38435 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGCXP38435 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGCXP38435 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGCXP38435 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGCXP38435 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGCXP38435 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGCXP38435 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGCXP38435 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GGCXP38435 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGCXP38435 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GGCXP38435 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGCXP38435 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGCXP38435 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGCXP38435 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGCXP38435 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGCXP38435 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGCXP38435 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGCXP38435 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGCXP38435 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGCXP38435 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGCXP38435 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGCXP38435 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGCXP38435 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGCXP38435 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGCXP38435 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGCXP38435 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGCXP38435 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGCXP38435 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGCXP38435 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGCXP38435 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGCXP38435 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGCXP38435 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms