Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF8P32971 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF8P32971 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF8P32971 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF8P32971 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF8P32971 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF8P32971 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF8P32971 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF8P32971 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF8P32971 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF8P32971 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF8P32971 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF8P32971 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF8P32971 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF8P32971 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF8P32971 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF8P32971 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF8P32971 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF8P32971 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF8P32971 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TNFSF8P32971 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF8P32971 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms