Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL1P28749 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL1P28749 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL1P28749 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL1P28749 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL1P28749 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL1P28749 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL1P28749 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL1P28749 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBL1P28749 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL1P28749 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL1P28749 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL1P28749 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL1P28749 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBL1P28749 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL1P28749 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL1P28749 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBL1P28749 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL1P28749 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RBL1P28749 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBL1P28749 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RBL1P28749 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBL1P28749 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL1P28749 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL1P28749 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL1P28749 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL1P28749 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL1P28749 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBL1P28749 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL1P28749 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL1P28749 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL1P28749 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL1P28749 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL1P28749 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL1P28749 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBL1P28749 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL1P28749 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL1P28749 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL1P28749 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL1P28749 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBL1P28749 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL1P28749 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL1P28749 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBL1P28749 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBL1P28749 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL1P28749 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL1P28749 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL1P28749 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL1P28749 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL1P28749 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBL1P28749 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL1P28749 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL1P28749 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL1P28749 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBL1P28749 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL1P28749 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL1P28749 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBL1P28749 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBL1P28749 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBL1P28749 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBL1P28749 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBL1P28749 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBL1P28749 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBL1P28749 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBL1P28749 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBL1P28749 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBL1P28749 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBL1P28749 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBL1P28749 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBL1P28749 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBL1P28749 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBL1P28749 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBL1P28749 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBL1P28749 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBL1P28749 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBL1P28749 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBL1P28749 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBL1P28749 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBL1P28749 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBL1P28749 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RBL1P28749 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RBL1P28749 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBL1P28749 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBL1P28749 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBL1P28749 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBL1P28749 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms