Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR1EP28566 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR1EP28566 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HTR1EP28566 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms