Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 SUF23tG(GCC)J2 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 SUF17tG(GCC)O2 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 RPS3YNL178W 723 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 PUS7YOR243C 2031 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP45P28004 ADE12YNL220W 1302 nt8.09□□□□□ -1.11
PRP45P28004 FRE5YOR384W 2085 nt8.09□□□□□ -1.11
PRP45P28004 MEH1YKR007W 555 nt8.09□□□□□ -1.11
PRP45P28004 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt8.09□□□□□ -1.11
PRP45P28004 RMD8YFR048W 1989 nt8.09□□□□□ -1.11
PRP45P28004 MIA40YKL195W 1212 nt8.08□□□□□ -1.12
PRP45P28004 YPL264CYPL264C 1062 nt8.08□□□□□ -1.12
PRP45P28004 YDR306CYDR306C 1437 nt8.08□□□□□ -1.12
PRP45P28004 ALD5YER073W 1563 nt8.08□□□□□ -1.12
PRP45P28004 HXK1YFR053C 1458 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP45P28004 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP45P28004 RFS1YBR052C 633 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP45P28004 SNT309YPR101W 528 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP45P28004 AMD2YDR242W 1650 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP45P28004 UTP4YDR324C 2331 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP45P28004 NUP84YDL116W 2181 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP45P28004 MIP1YOR330C 3765 nt8.06□□□□□ -1.12
PRP45P28004 HEM1YDR232W 1647 nt8.06□□□□□ -1.12
PRP45P28004 EDE1YBL047C 4146 nt8.05□□□□□ -1.12
PRP45P28004 SNO4YMR322C 714 nt8.05□□□□□ -1.12
PRP45P28004 HSP33YOR391C 714 nt8.05□□□□□ -1.12
PRP45P28004 HSP32YPL280W 714 nt8.05□□□□□ -1.12
PRP45P28004 KTR3YBR205W 1215 nt8.05□□□□□ -1.12
PRP45P28004 SKG1YKR100C 1068 nt8.04□□□□□ -1.12
PRP45P28004 YNL120CYNL120C 486 nt8.04□□□□□ -1.12
PRP45P28004 YEL023CYEL023C 2049 nt8.03□□□□□ -1.12
PRP45P28004 RGD2YFL047W 2145 nt8.02□□□□□ -1.13
PRP45P28004 YDL129WYDL129W 876 nt8.02□□□□□ -1.13
PRP45P28004 RIX7YLL034C 2514 nt8.02□□□□□ -1.13
PRP45P28004 PRY3YJL078C 2646 nt8.01□□□□□ -1.13
PRP45P28004 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt8.01□□□□□ -1.13
PRP45P28004 DAL3YIR032C 588 nt8.01□□□□□ -1.13
PRP45P28004 PNP1YLR209C 936 nt8.01□□□□□ -1.13
PRP45P28004 YCR041WYCR041W 333 nt8□□□□□ -1.13
PRP45P28004 CBP4YGR174C 513 nt8□□□□□ -1.13
PRP45P28004 DAP1YPL170W 459 nt8□□□□□ -1.13
PRP45P28004 COR1YBL045C 1374 nt7.99□□□□□ -1.13
PRP45P28004 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.99□□□□□ -1.13
PRP45P28004 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.99□□□□□ -1.13
PRP45P28004 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.99□□□□□ -1.13
PRP45P28004 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.99□□□□□ -1.13
PRP45P28004 SLA2YNL243W 2907 nt7.99□□□□□ -1.13
PRP45P28004 SEC24YIL109C 2781 nt7.98□□□□□ -1.13
PRP45P28004 YML012C-AYML012C-A 378 nt7.98□□□□□ -1.13
PRP45P28004 YKR018CYKR018C 2178 nt7.98□□□□□ -1.13
PRP45P28004 PXL1YKR090W 2121 nt7.97□□□□□ -1.13
PRP45P28004 GNP1YDR508C 1992 nt7.97□□□□□ -1.13
PRP45P28004 YLR112WYLR112W 420 nt7.97□□□□□ -1.13
PRP45P28004 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt7.97□□□□□ -1.13
PRP45P28004 ATG12YBR217W 561 nt7.97□□□□□ -1.13
PRP45P28004 ILV1YER086W 1731 nt7.97□□□□□ -1.13
PRP45P28004 SPT3YDR392W 1014 nt7.96□□□□□ -1.14
PRP45P28004 LDB18YLL049W 540 nt7.96□□□□□ -1.14
PRP45P28004 AIM33YML087C 939 nt7.96□□□□□ -1.14
PRP45P28004 MRPL22YNL177C 930 nt7.96□□□□□ -1.14
PRP45P28004 PUF3YLL013C 2640 nt7.96□□□□□ -1.14
PRP45P28004 NHA1YLR138W 2958 nt7.95□□□□□ -1.14
PRP45P28004 MCH1YDL054C 1461 nt7.95□□□□□ -1.14
PRP45P28004 AQR1YNL065W 1761 nt7.95□□□□□ -1.14
PRP45P28004 SEC13YLR208W 894 nt7.95□□□□□ -1.14
PRP45P28004 CIN4YMR138W 576 nt7.95□□□□□ -1.14
PRP45P28004 PRI2YKL045W 1587 nt7.95□□□□□ -1.14
PRP45P28004 MRK1YDL079C 1506 nt7.94□□□□□ -1.14
PRP45P28004 SNF4YGL115W 969 nt7.94□□□□□ -1.14
PRP45P28004 LDS1YAL018C 978 nt7.94□□□□□ -1.14
PRP45P28004 RGT2YDL138W 2292 nt7.94□□□□□ -1.14
PRP45P28004 TOK1YJL093C 2076 nt7.93□□□□□ -1.14
PRP45P28004 ADY2YCR010C 852 nt7.93□□□□□ -1.14
PRP45P28004 MTR3YGR158C 753 nt7.93□□□□□ -1.14
PRP45P28004 PEX13YLR191W 1161 nt7.93□□□□□ -1.14
PRP45P28004 MRPS5YBR251W 924 nt7.93□□□□□ -1.14
PRP45P28004 PMA2YPL036W 2844 nt7.92□□□□□ -1.14
PRP45P28004 ERS1YCR075C 783 nt7.92□□□□□ -1.14
PRP45P28004 COX20YDR231C 618 nt7.92□□□□□ -1.14
PRP45P28004 EFM4YIL064W 774 nt7.92□□□□□ -1.14
PRP45P28004 MRP17YKL003C 396 nt7.92□□□□□ -1.14
PRP45P28004 MSY1YPL097W 1479 nt7.91□□□□□ -1.14
PRP45P28004 TPO3YPR156C 1869 nt7.91□□□□□ -1.14
PRP45P28004 PRB1YEL060C 1908 nt7.91□□□□□ -1.14
PRP45P28004 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.9□□□□□ -1.14
PRP45P28004 VMA16YHR026W 642 nt7.9□□□□□ -1.14
PRP45P28004 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt7.9□□□□□ -1.14
PRP45P28004 ERI1YPL096C-A 207 nt7.9□□□□□ -1.14
PRP45P28004 YPT1YFL038C 621 nt7.89□□□□□ -1.15
PRP45P28004 AAD15YOL165C 432 nt7.89□□□□□ -1.15
PRP45P28004 HBN1YCL026C-B 582 nt7.89□□□□□ -1.15
PRP45P28004 MDM31YHR194W 1740 nt7.89□□□□□ -1.15
PRP45P28004 GEF1YJR040W 2340 nt7.88□□□□□ -1.15
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