Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM3P25205 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM3P25205 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM3P25205 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM3P25205 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM3P25205 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM3P25205 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM3P25205 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM3P25205 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM3P25205 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM3P25205 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM3P25205 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM3P25205 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3P25205 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3P25205 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3P25205 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3P25205 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3P25205 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3P25205 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3P25205 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3P25205 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3P25205 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3P25205 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3P25205 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3P25205 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM3P25205 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM3P25205 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM3P25205 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM3P25205 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM3P25205 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3P25205 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3P25205 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3P25205 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3P25205 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3P25205 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3P25205 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3P25205 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3P25205 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3P25205 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3P25205 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3P25205 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3P25205 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3P25205 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3P25205 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3P25205 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3P25205 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3P25205 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3P25205 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM3P25205 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM3P25205 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM3P25205 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3P25205 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3P25205 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3P25205 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3P25205 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3P25205 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3P25205 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3P25205 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3P25205 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3P25205 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3P25205 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3P25205 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3P25205 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3P25205 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3P25205 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3P25205 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3P25205 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3P25205 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3P25205 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3P25205 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3P25205 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3P25205 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3P25205 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3P25205 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3P25205 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3P25205 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3P25205 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3P25205 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3P25205 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM3P25205 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM3P25205 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3P25205 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3P25205 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3P25205 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3P25205 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3P25205 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3P25205 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3P25205 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3P25205 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3P25205 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3P25205 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms