Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCND1P24385 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND1P24385 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND1P24385 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND1P24385 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND1P24385 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND1P24385 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND1P24385 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND1P24385 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND1P24385 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND1P24385 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND1P24385 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND1P24385 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND1P24385 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND1P24385 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND1P24385 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND1P24385 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND1P24385 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND1P24385 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND1P24385 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND1P24385 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND1P24385 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND1P24385 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND1P24385 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND1P24385 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND1P24385 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND1P24385 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND1P24385 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND1P24385 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND1P24385 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND1P24385 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND1P24385 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND1P24385 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND1P24385 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND1P24385 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND1P24385 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND1P24385 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND1P24385 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND1P24385 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND1P24385 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND1P24385 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND1P24385 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND1P24385 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND1P24385 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND1P24385 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND1P24385 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND1P24385 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND1P24385 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND1P24385 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND1P24385 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND1P24385 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND1P24385 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND1P24385 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND1P24385 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND1P24385 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND1P24385 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND1P24385 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND1P24385 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND1P24385 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND1P24385 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND1P24385 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND1P24385 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND1P24385 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND1P24385 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND1P24385 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND1P24385 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND1P24385 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND1P24385 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND1P24385 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND1P24385 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND1P24385 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND1P24385 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND1P24385 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND1P24385 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND1P24385 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND1P24385 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND1P24385 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND1P24385 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND1P24385 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND1P24385 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND1P24385 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND1P24385 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND1P24385 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND1P24385 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND1P24385 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND1P24385 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND1P24385 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND1P24385 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND1P24385 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND1P24385 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND1P24385 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms