Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD9P21926 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD9P21926 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD9P21926 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD9P21926 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD9P21926 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD9P21926 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD9P21926 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD9P21926 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD9P21926 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD9P21926 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD9P21926 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD9P21926 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD9P21926 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD9P21926 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD9P21926 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD9P21926 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD9P21926 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD9P21926 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD9P21926 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD9P21926 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD9P21926 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD9P21926 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD9P21926 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD9P21926 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD9P21926 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD9P21926 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD9P21926 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD9P21926 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD9P21926 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD9P21926 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD9P21926 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD9P21926 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD9P21926 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD9P21926 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CD9P21926 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD9P21926 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD9P21926 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD9P21926 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD9P21926 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD9P21926 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD9P21926 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD9P21926 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD9P21926 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD9P21926 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD9P21926 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD9P21926 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD9P21926 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD9P21926 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD9P21926 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD9P21926 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD9P21926 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD9P21926 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD9P21926 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD9P21926 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD9P21926 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD9P21926 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD9P21926 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD9P21926 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD9P21926 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD9P21926 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD9P21926 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD9P21926 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD9P21926 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD9P21926 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD9P21926 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD9P21926 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD9P21926 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD9P21926 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CD9P21926 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD9P21926 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD9P21926 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CD9P21926 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD9P21926 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD9P21926 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD9P21926 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD9P21926 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD9P21926 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD9P21926 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD9P21926 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD9P21926 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD9P21926 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms