Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN3P20807 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN3P20807 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN3P20807 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms