Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTF3P20783 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTF3P20783 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTF3P20783 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTF3P20783 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTF3P20783 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTF3P20783 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NTF3P20783 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTF3P20783 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTF3P20783 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTF3P20783 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTF3P20783 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTF3P20783 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTF3P20783 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTF3P20783 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTF3P20783 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTF3P20783 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NTF3P20783 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTF3P20783 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTF3P20783 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTF3P20783 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTF3P20783 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTF3P20783 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTF3P20783 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTF3P20783 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTF3P20783 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NTF3P20783 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTF3P20783 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTF3P20783 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTF3P20783 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NTF3P20783 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTF3P20783 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTF3P20783 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTF3P20783 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTF3P20783 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTF3P20783 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTF3P20783 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTF3P20783 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NTF3P20783 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTF3P20783 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTF3P20783 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTF3P20783 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NTF3P20783 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTF3P20783 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF3P20783 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF3P20783 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF3P20783 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF3P20783 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF3P20783 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF3P20783 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF3P20783 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTF3P20783 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF3P20783 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF3P20783 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF3P20783 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF3P20783 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF3P20783 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF3P20783 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF3P20783 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTF3P20783 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF3P20783 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF3P20783 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF3P20783 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF3P20783 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF3P20783 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NTF3P20783 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF3P20783 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF3P20783 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF3P20783 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF3P20783 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF3P20783 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF3P20783 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF3P20783 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF3P20783 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NTF3P20783 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms