Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF1BP20333 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms